基因测序仪Miseq是illumina公司于2011年2月推出的一款小型测序平台，可对数百万个片段同时进行大规模平行测序，它是目前唯一一台在单个仪器上整合簇生成、末端配对测序及数据分析的新一代测序仪。该仪器为中心实验室分子实验平台较为重要的高端大型仪器之一，自2012年正式投入运行以来，已为我园多个课题组提供宏基因组、转录组及微生物基因组等多项测序服务。 

　　随着我园科研研究工作不断深入和发展，越来越多的科研工作者倾向于利用基因测序结果解决分子生物学、细胞生物学和生态学方面的科研问题。为适应这一需要，同时确保今后测序结果的稳定性和可靠性，中心实验室邀请Illumina技术工程师魏鹏于3月17日至18日对我园Miseq测序仪进行全面检修、维护和软件升级。 

　　工程师首先对最近几次的测序结果进行全面分析、诊断，确定仪器光路偏转导致测序产生的结果图片模糊、Q30值、PF值及有效数据量偏低。随后通过2天的校正调试，仪器光路恢复正常，上述问题得到彻底解决。在光路调整之后，仪器工程师和周翔、曹力现场指导能源植物分子育种研究组陈茂盛博士进行小桐子转录组基因的测序工作。测序完成后，其PF值为74.12％，获得8.5G的数据量（其中有效数据量达6.3G），接近该测序试剂盒理论数据产量的最大值。在仪器光路调试、校正过程中，技术工程师同时对中心实验室Miseq测序平台软件进行升级。将现在的18M Reads、2x250bp读长及8Gb数据量升级至25MReads、2x300bp读长及15Gb的数据产量。 

　　本次的检修和软件升级大大拓宽了基因测序仪在分子生物学、细胞生物学、生态学上的应用范围，提升中心实验室的测序支撑能力的同时为我园各个研究组提供强有力的测序技术支持。周翔撰文

Illumina技术工程师魏鹏正在对仪器光路进行精细校准